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ngs全基因組測(cè)序檢測(cè)

原創(chuàng)發(fā)布者：北檢院發(fā)布時(shí)間：2024-01-19 點(diǎn)擊數(shù)：

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ngs全基因組測(cè)序檢測(cè)范圍

生物信息學(xué)

高通量測(cè)序

基因組學(xué)

遺傳學(xué)研究

動(dòng)植物基因組

基因組測(cè)序技術(shù)

下一代基因測(cè)序

生物數(shù)據(jù)分析

基因組注釋

人類基因組測(cè)序

疾病研究

表達(dá)譜分析

基因組比較

突變分析

進(jìn)化研究

重測(cè)序

數(shù)據(jù)解讀

功能預(yù)測(cè)

基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

ngs全基因組測(cè)序檢測(cè)項(xiàng)目

基因組裝 DNA甲基化分析 RNA測(cè)序轉(zhuǎn)錄組分析轉(zhuǎn)錄本定量基因表達(dá)分析變異檢測(cè) 結(jié)構(gòu)變異檢測(cè) 染色體異質(zhì)性檢測(cè) SNP分析基因組重測(cè)序外顯子組重測(cè)序 mRNA測(cè)序 miRNA測(cè)序單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序染色體畸變檢測(cè) 人類遺傳病基因篩查脫氧核糖核酸測(cè)序完整基因組重測(cè)序轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)分析 DNA復(fù)雜性分析蛋白質(zhì)組學(xué)分析全基因組等位基因檢測(cè) 位點(diǎn)突變檢測(cè) 遺傳多樣性分析 SNV檢測(cè) CNV檢測(cè) 分型分析富集測(cè)序 X染色體測(cè)序 Y染色體測(cè)序 methyl-seq測(cè)序序列比對(duì)與拼接宏基因組學(xué)分析細(xì)菌基因組測(cè)序真菌基因組測(cè)序植物基因組測(cè)序動(dòng)物基因組測(cè)序微生物組測(cè)序全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序元轉(zhuǎn)錄組測(cè)序環(huán)境微生物組測(cè)序

ngs全基因組測(cè)序檢測(cè)方法

對(duì)于ngs全基因組測(cè)序的樣品，可以采用以下方法進(jìn)行檢測(cè)：

1. 庫(kù)構(gòu)建：將樣品中的DNA片段進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建，包括斷裂DNA，連接接頭，PCR擴(kuò)增等步驟。

2. 文庫(kù)質(zhì)檢：使用聚合酶鏈反應(yīng)（PCR）擴(kuò)增文庫(kù)，并使用凝膠電泳等方法來檢測(cè)文庫(kù)的質(zhì)量和大小分布。

3. NGS測(cè)序平臺(tái)選擇：根據(jù)樣品的特點(diǎn)和研究目的，選擇適合的NGS測(cè)序平臺(tái)，如Illumina HiSeq，PacBio SMRT，Ion Torrent等。

4. DNA文庫(kù)測(cè)序：將文庫(kù)片段進(jìn)行高通量測(cè)序，生成大量的短序列reads。

5. 數(shù)據(jù)預(yù)處理：根據(jù)測(cè)序技術(shù)和測(cè)序平臺(tái)，對(duì)原始序列數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量控制、去除接頭、過濾低質(zhì)量reads等預(yù)處理步驟。

6. 數(shù)據(jù)比對(duì)：使用比對(duì)算法，將預(yù)處理后的reads與參考基因組進(jìn)行比對(duì)，以確定每個(gè)reads的位置和方向。

7. 變異檢測(cè)：通過比對(duì)結(jié)果，進(jìn)行單核苷酸變異（SNV）、插入/缺失（Indel）和結(jié)構(gòu)性變異等的檢測(cè)和分析。

8. 功能注釋：對(duì)檢測(cè)到的變異進(jìn)行功能注釋，包括基因本體學(xué)（Gene Ontology）、通路分析（Pathway）等。

9. 數(shù)據(jù)解讀：根據(jù)上述分析結(jié)果，對(duì)樣品的基因組結(jié)構(gòu)、變異情況和可能的功能影響進(jìn)行解讀和分析。

10.結(jié)果報(bào)告：將分析結(jié)果進(jìn)行整理和歸納，撰寫最終的檢測(cè)報(bào)告，以便后續(xù)的研究和應(yīng)用。

ngs全基因組測(cè)序檢測(cè)儀器

NGS全基因組測(cè)序, Maldi-TOF質(zhì)譜儀, 電化學(xué)檢測(cè)儀, 細(xì)胞培養(yǎng)儀, PCR儀, 真空離心機(jī), 高壓液相色譜儀, 氣相色譜儀, 紫外可見分光光度計(jì), 熒光分光光度計(jì), 激光共焦顯微鏡, 電子顯微鏡, 核磁共振儀, 氣溶膠質(zhì)譜儀, 掃描電子顯微鏡, 傅立葉變換紅外光譜儀, 流式細(xì)胞儀, 微孔板閱讀器, 煅燒石英管, 核酸電泳儀, 高通量離心機(jī)