全基因組轉錄組檢測

原創發布者：北檢院發布時間：2024-01-19 點擊數：

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全基因組轉錄組檢測范圍

蛋白質組,表觀遺傳組,代謝組,細胞組,信號傳導組,非編碼RNA組,微生物組,遺傳組,遺傳變異組,多樣性組,功能組,結構組,表達組,調控組,介導組,互作組,組裝組,修飾組,調控組,分解組

全基因組轉錄組檢測項目

全基因組測序,外顯子組測序,基因組重測序,全轉錄組測序,甲基化測序,SNP檢測,插入/缺失突變檢測,基因表達差異分析,蛋白質組學分析,微生物組檢測,轉錄因子結合位點分析,剪切變異檢測,外源DNA檢測,個體疾病相關位點檢測,表觀遺傳分析,疾病相關SNP檢測,病毒加載檢測,免疫組織化學分析,DNA甲基化分析,組蛋白修飾分析,轉錄調控網絡分析。

全基因組轉錄組檢測方法

全基因組轉錄組測序方法（RNA-Seq）：

RNA-Seq是一種高通量測序技術，可以用來研究轉錄組的全面表達情況。該方法基于Illumina或Ion Torrent等平臺，通過將RNA提取、轉錄為cDNA，并進行文庫構建和測序，從而獲得轉錄組的信息。

實時定量PCR（qPCR）：

實時定量PCR是一種常用的轉錄組研究方法，用于定量分析特定基因的轉錄水平。該方法利用引物和熒光探針與目標基因的轉錄產物結合，并通過PCR循環的每個階段監測熒光信號的變化，從而實現對轉錄水平的定量分析。

原位雜交（ISH）：

原位雜交是一種用來確定特定基因在組織或細胞中表達情況的方法。通過將標記有親和性探針的核酸與待測樣品進行雜交，然后對雜交的探針進行檢測，可以確定目標基因的表達位置和強度。

Northern blotting：

Northern blotting是一種傳統蛋白質電泳技術，用于檢測特定基因的轉錄水平。該方法利用RNA分子的大小和電荷特性，通過電泳將RNA分離，并使用探針特異性地檢測目標基因的轉錄產物。

核糖核酸電泳（RFLP）：

核糖核酸電泳是一種常用的分析DNA序列差異和基因多態性的方法。該方法通過將DNA進行限制性內切酶切割，然后使用電泳將DNA片段按照大小分離，從而分析DNA序列的差異。

基因芯片技術：

基因芯片技術是一種高通量測序方法，用于同時檢測大量基因的轉錄水平。該方法通過將cDNA文庫與固定在芯片上的核酸片段進行雜交，然后使用熒光信號檢測技術來確定目標基因的表達水平。

逆轉錄聚合酶鏈式反應（RT-PCR）：

逆轉錄聚合酶鏈式反應是一種常用的轉錄組研究方法，用于合成DNA的互補DNA（cDNA）。該方法通過使用逆轉錄酶將RNA轉錄為cDNA，然后使用PCR技術擴增目標基因的cDNA片段，并通過凝膠電泳分析進行檢測。

轉錄因子結合位點分析：

轉錄因子結合位點分析用于研究轉錄因子與基因的調控關系。該方法通過在基因組中尋找與轉錄因子結合相關的DNA序列，從而預測轉錄因子的結合位點，并分析其在轉錄調控中的功能。

代謝物組學分析：

代謝物組學分析用于研究轉錄組與代謝物譜之間的關系。該方法通過分析樣品中的代謝產物，如代謝物濃度、組成和性質等，來理解轉錄組在代謝過程中的作用。

差異表達基因分析：

差異表達基因分析用于研究不同條件下轉錄組的差異表達情況。該方法通過比較不同樣品中基因的表達水平，篩選出在不同條件下顯著差異表達的基因，并進行功能注釋和通路分析。

全基因組轉錄組檢測儀器

PCR cycler, DNA sequencer, microarray scanner, qPCR machine, gel electrophoresis system, high-throughput sequencer, flow cytometer, mass spectrometer, spectrophotometer, microplate reader, capillary electrophoresis system, thermal cycler, fluorescence microscope, cytometer, microarray reader, DNA amplification system, MALDI-TOF mass spectrometer, next-generation sequencer, DNA microarray scanner, digital PCR system